Управління гімназією в межах повноважень, визначених законами та установчими документами цього закладу, здійснюють:
- засновник (Краснопільська сільська рада Гайсинського району Вінницької області);
- орган управління освітою (відділ освіти, культури, молоді та спорту Краснопільської сільської ради);
- директор;
- колегіальний орган управління закладу освіти (педагогічна рада);
- колегіальний орган громадського самоврядування (рада, загальношкільний батьківський комітет).
Вищим колегіальним органом громадського самоврядування є загальні збори колективу гімназії.
